Matlab/VBM習得勉強会

2019年12月01日に開催予定である 『Matlab/VBM習得勉強会』 の受講者を 対象とした情報提供サイトです。新しい情報があれば、随時このサイトへ 追加していきますので、定期的にアクセスするようにして下さい。

新着情報

• 2019.11.29: 第3部(2)のテキストを微修正しました。
• 2019.11.24: 第4部および第5部のテキストおよびデータを公開しました。
• 2019.11.22: 第3部(2)のテキストおよびスクリプトを公開しました。
• 2019.11.16: 第3部(1)のテキストおよびデータを公開しました。
• 2019.11.13: 第1部と第2部のテキストおよびデータを公開しました。
• 2019.11.13: Windows用にGit for Windowsの解説を掲載しました。
• 2019.11.05: 予習テキストに間違いがひとつあったため、修正しました。改めてダウンロードしてください。
• 2019.11.04: 予習テキストをアップしました。
• 2019.11.04: 勉強会用ウェブサイトを立ち上げました。

会場案内

• オフィス東京

チュートリアル当日のお願い

• 会場は、飲食可能です。しかし、コンピュータを使いますので、コーヒーをキーボードの上にこぼすといった悲劇が起こらないよう、ふたのついた飲み物の持ち込みにご協力ください。昼食は、会場内で召し上がっていただいてかまいません。
• 開場時間は 08:30 です。いろいろ不安な方は早めにお越しいただき、講師やチューターとコミュニケーションをとっておくことをお勧めします。
• 会場に到着したら、まず受付をお願いします。

勉強会までの予定

• 2019.11.15: 2週間前までに勉強会のテキストやデータを配布します。

勉強会のスケジュール(予定)

時間	内容
事前予習	心理のためのMATLABチュートリアル
08:30	開場
09:00-09:05	開会
09:05-10:35	第1部: 脳画像解析の観点でのMatlabの基本
10:45-12:00	第2部: SPM.mat, xSPMの探検
12:00-13:00	– 昼食 –
13:00-14:00	第3部: SPMを利用したバッチ処理(1)
14:15-15:30	第3部: SPMを利用したバッチ処理(2)
15:45-16:15	第4部: SPMの結果表示
16:15-17:00	第5部: 「今さら聞けないことを聞きたい」コーナー
17:00-17:30	質疑応答

パソコンの持参について

• 勉強会では、受講者にPCを持参して頂き、実際に操作しながらコマンドラインについて学んでいきます。PCのスペックについては、以下の推奨条件を参考にして下さい
  • Windowsユーザー
    • Windows 7以降 64bit版
    • メモリ：8GB以上
    • ハードディスク：30GB以上の空き容量
    • 2ボタン以上のUSBマウス（必須ではありませんが、持っていると便利です）
  • Macユーザー
    • macOS 10.11(El Captain)以降
    • メモリ：8GB以上
    • ハードディスク：30GB以上の空き容量
    • 2ボタン以上のUSBマウス（必須ではありませんが、持っていると便利です）

事前準備

(1) ソフトウェア

• Matlab

今回はMatlabは必須です。各自準備してきてください。

• SPM12

「すぐできるVBM」などを参考にしながら、SPMのインストールを済ませてきてください。

• (Windowsのみ) Git for Windows

  • https://gitforwindows.org/ から、Git for Windowsをダウンロードしてください。
  • インストールはすべてデフォルトのまま行ってください。

(2) 勉強会のデータ保存場所

今回の作業スペースは、以下のようにします。

• Windows: C:\img_data\nisg-201912
• Mac: /Users/ユーザ名/img_data/nisg-201912

以下のようにしてください。

• Macの方
  • ターミナルを起動してください。

  • 以下をタイプしてください。

    cd img_data

  • エラーが出る場合は以下で作成してください

    mkdir img_data

  • 以下をタイプしてください。

    git clone https://github.com/kytk/nisg-201912

  • これでテキストおよびデータがダウンロードできます。

  • アップデートは以下で行います。

    cd img_data/nisg-201912

    git pull

• Windowsの方
  • c:\img_data をエクスプローラーであけてください。
  • 何もないところで右クリックします。
  • “Git Bash Here” をクリックします。

  • そうすると、ターミナル画面があらわれますので、以下をタイプしてください。

    git clone https://github.com/kytk/nisg-201912

  • これでテキストおよびデータがダウンロードできます。

  • アップデートするときは、c:\img_data\nisg-201912 にエクスプローラーで移動し、何もないところで右クリックし、”Git Bash Here”でターミナルを立ち上げて以下のようにタイプします。

    git pull

(3) テキストおよびデータのダウンロード

• 予習テキスト

  • 「心理のためのMatlabチュートリアル」を予習テキストとします。ex0に入っている内容がそれになります。当日までに、レッスン1〜レッスン8と、練習A,B,C,Eをやってみてください。回答もありますので、参考にしていただけたらと思います。

• 当日のテキストおよびデータセット

  • 11月24日に、すべてのテキストおよびデータを公開しました。上記 Gitを使ってダウンロードをお願いします。

問い合わせ

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